Western Blot實驗過程中常遇到的問題
Western 免疫印跡（Western Blot）是將蛋白質轉移到膜上，然后利用抗體進行檢測。對已知表達蛋白，可用相應抗體作為一抗進行檢測，對新基因的表達產物，可通過融合部分的抗體檢測。
WB 實驗中常會出現各種問題，迪申生物技術（上海）有限公司專注于生物試劑免疫組化相關產品多年，對 WB 實驗有一定了解，今天跟各位同學一起分享下 WB 實驗中各種問題及應用對策。
電泳條帶成笑臉狀 膠不均勻冷切，中間冷卻不好，電泳系統溫度偏高 減少電壓減慢電泳速度，在冷室或者冰浴中進行電泳
電泳條帶成皺眉狀 可能是由于裝置不合適，特別可能是凝膠和玻璃擋板底部有氣泡，或者兩邊聚合不* 調整裝置
拖尾 樣品溶解不好 樣品充分溶解混勻后上樣
紋理(縱向條紋) 樣品中含有不溶性顆粒 樣品充分攪拌混勻
條帶偏斜 電極不平衡或者加樣位置偏斜 調整電極和加樣
條帶兩邊擴散 加樣量過多 適當減少上樣量
Marker 變黑色 抗體和 Marker 蛋白反應 在 Marker 和 sample 之間空出一個孔不上樣
背景高 膜封閉不夠 延長封閉時間，選擇適宜的抗體稀釋度
一抗稀釋度不適宜 對抗體進行滴度測試，選擇適宜的抗體稀釋度
一抗孵育的溫度偏高 建議 4℃ 結合過夜
二抗濃度度過高 降低二抗濃度
二抗的非特異性背景 增加一個二抗對照，不加一抗，其他操作過程不變，即可驗證背景是否是由于二抗所致。可選擇其它二抗（特異性更強的，只針對重鏈）
二抗孵育時間過久 減少二抗孵育時間
選擇膜的問題 硝酸纖維素的背景會比 PVDF 膜低
膜在實驗過程中干過 實驗過程中要注意保持膜的濕潤
檢測時曝光時間過長 注意曝光時間的縮短
洗膜不充分 增加洗膜的時間和次數
抗體和封閉蛋白有交叉反應 檢測抗體與封閉蛋白的交叉反應性，選擇無交叉反應的封閉劑。洗滌液中加入 Tween-20 可減少交叉反應
雜帶較多 目的蛋白有多個修飾位點（化位點，糖基化位點，乙酰化位點等），本身可以呈現多條帶 查閱文獻或進行生物信息學分析，獲得蛋白序列的修飾位點信息，通過去修飾確定蛋白試劑大小
目的蛋白有其他剪切本 查閱文獻或生物信息學分析可能性
樣品處理過程中目的蛋白發生降解 裂解液中加入蛋白酶抑制劑，樣品處理在冰上進行
上樣量過高，太敏感 適當減少上樣量
一抗不純 純化抗體
一抗特異性不高 重新選擇或制備高特異性的抗體
二抗的非特異性結合 增加一個二抗對照，不加一抗，其他操作過程不變，即可驗證背景是否是由于二抗所致。可選擇其它二抗（特異性更強的，只針對重鏈）
一抗或二抗濃度偏高 降低抗體濃度
細胞傳代較多，導致蛋白變異 使用原代或傳代少的細胞作對照
蛋白條帶位置
（大小）不對 二聚體或多聚體存在 增加蛋白質變性過程及強度
翻譯后剪切 比如很多蛋白是以前體蛋白的形式合成的，在執行功能時需要進行剪切成活化的形式
相對電荷 氨基酸電荷的組成
蛋白修飾 比如糖基化、化等修飾狀態會導致蛋白分子量增加
膠濃度 不同濃度的膠跑出的蛋白條帶的位置可能有所偏差
無蛋白條帶 抗體孵育不充分 增加抗體濃度，延長孵育時間
酶失活 直接將酶和底物進行混合，如果不顯色則說明酶失活了。選擇在有效期內、有活性的酶聯物
標本中不含靶蛋白或靶蛋白含量太低 設置陽性對照，如果陽性對照有結果，但標本沒有則可能是標本中不含靶蛋白或靶蛋白含量太低。可考慮增加標本上樣量解決靶蛋白含量低的原因
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